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Publikationen von Onto-Med

Onto-Med Reports

Wissenschaftliche Reports

Heller, B., Herre, H., Burek, P., Loebe, F., Michalek, H. 2005. General Ontological Language (GOL) Version 1.1D: A Formal Framework for Building and Representing Ontologies. Onto-Med Report Nr. 8. Forschungsgruppe Ontologies in Medicine, Universität Leipzig. (in Vorbereitung)

Loebe, F. An Analysis of Roles. Onto-Med Report Nr. 6/2003. Research Group Ontologies in Medicine, University of Leipzig. [PDF]

Heller, B., Lippoldt, K., Kühn, K. 2003. Guideline for Creating Medical Terms. Onto-Med Report Nr. 4/2003. Forschungsgruppe Ontologies in Medicine, Universität Leipzig.
[PDF]

Heller, B., Herre, H., Löffler, M. Forschungsantrag. Onto-Med Report Nr. 2/2003. Forschungsgruppe Ontologies in Medicine, Universität Leipzig, (erscheint 2005).

Heller, B., Herre, H. 2003. Formal Ontology and Principles of GOL. Onto-Med Report Nr. 1/2003. Forschungsgruppe Ontologies in Medicine, Universität Leipzig.

Technische Reports

Heller, B., Lippoldt, K., Kühn, K. 2003. The Onto-Builder Handbook Version 1.1 Part I: The Construction of Medical Terms. Technischer Report. Onto-Med Report Nr. 5/2003. Forschungsgruppe Ontologies in Medicine, Universität Leipzig. [PDF]

Heller, B., Lippoldt, K., Kühn, K. 2003. Leitfaden für die Eingabe von Begriffen in den OntoBuilder. IMISE-Report Nr. 4/2003. Universität Leipzig.

Heller, B., Lippoldt, K., Kühn, K. 2003. Handbuch OntoBuilder. IMISE-Report Nr. 3/2003. Universität Leipzig.

Andere Reports

Heller, B., Löffler, M. 2002. Telematics and Computer-Based Quality Management in a Communication Network for Malignant Lymphoma. IMISE-Report Nr. 1/2002. Universität Leipzig.

Heller, B., Herre, H., Smith, B. 2002. Ontological Spring. 17. - 20. April. IFOMIS Report Nr. 1/2002. Universität Leipzig.

Bücher/Tagungsbände

Fähnrich, K.-P., Herre, H. (eds.) 2003. Content und Wissensmanagement. 11. Leipziger Informatik-Tage (LIT 2003), 24.-26. Sept. 2003. Leipzig.

Heller, B., Löffler, M., Musen, M., Stefanelli, M. (eds.) 2001. Computer-Based Support for Clinical Guidelines and Protocols. EWGLP 2000, Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 83. Amsterdam: IOS Press. ISBN 1-58603-193-7.

Buchbeiträge

Heller B., Herre, H. 2003. Ontological Categories in GOL. In: Seibt, J. (ed.) Process Theories: Crossdisciplinarystudies in Dynamic Categories. p. 57-77. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers.

Begutachtete Artikel in Zeitschriften und Tagungsbänden

Burek, P. 2005. Essentialized Conceptual Structures in Ontology Modeling. Akzeptiert für KES 2005.

Burek, P. & Grabos, R. 2005. Dually Structured Concepts in the Semantic Web: Answer Set Programming Approach. In: Gómez-Pérez, A. & Euzenat, J. (ed.) The Semantic Web: Research and Applications. Proceedings of the Second European Semantic Web Conference, ESWC 2005, Heraklion, Crete, Greece, May 29 - Jun 1. Lecture Notes in Computer Science, Vol. 3532, p. 377-391. Springer. [PDF]

Dietzold, S. 2005. Generating RDF Models from LDAP Directories.. In: Auer S., Bizer C. and Miller L. (ed.) Proceedings of the SFSW 05 Workshop on Scripting for the Semantic Web , Hersonissos, Crete, Greece, May 30, 200. CEUR Workshop Proceeding, Vol. 135. CEUR-WS. [PDF]

Heller, B.; Kühn, K. & Löffler, M. 2005. Onto-Builder: Software-Werkzeug für den Aufbau von Data Dictionaries. In: Steyer, G. & Tolxdorff, T. (ed.) bit for bit: Halbzeit auf dem Weg zur Telematikinfrastruktur. p. 108-114. Berlin: Akademische V.-G. Aka. [PDF]

Herre, H., Heller, B. 2005. Semantic Foundations of Medical Information Systems Based on Top-Level Ontologies. Akzeptiert für das Journal of Knowledge-Based Systems.

Herre, H., Heller, B. 2005. Ontology of Time and Situoids in Medical Conceptual Modeling. Akzeptiert für AIME 2005.

Loebe, F. 2005. Abstract vs. Social Roles: A Refined Top-Level Ontological Analysis. Akzeptiert für 2005 AAAI Fall Symposium "Roles, an interdisciplinary perspective". [PDF]

Auer, S., Burek, P., Grawe, T. 2004. Knowledge Engineering for IT-based Services. In: Proceedings of the 4th International Conference on Knowledge Management (I-KNOW'04), Jun 30 - Jul 2, 2004, Graz, Austria. p. 113-124. Graz: Know-Center Graz. [PDF]

Burek, P. 2004. Adoption of the Classical Theory of Definition to Ontology Modeling. In: Bussler, C., Fensel, D. (eds.) Artificial Intelligence: Methodology, Systems, and Applications. Proceedings of the 11th International Conference, AIMSA 2004, Sep 2-4, Varna, Bulgaria. Lecture Notes in Computer Science, Vol. 3192, p. 1-10. Berlin: Springer. [PDF]

Guizzardi, G., Wagner, G., Herre, H. 2004. On the Foundations of UML as an Ontology Representation Language. In: Motta, E., Shadbolt, N., Stutt, A., Gibbins, N. (eds.) Engineering Knowledge in the Age of the Semantic Web: Proceedings of the 14th International Conference (EKAW 2004), Whittlebury Hall, UK, Oct 2004. Lecture Notes in Computer Science, Vol. 3257, p. 47-62. Berlin: Springer.

Heller, B., Herre, H. 2004. Ontological Foundations of Medical Information Systems, New Trends in Software Methodologies, Tools and Techniques: Proceedings of the third SoMeT_W04 eds. Fujita, Hamido and Gruhn, Volker, Frontiers in Artificial Intelligence and Applications, Vol. 111, p. 3-17. Amsterdam: IOS Press.

Meineke, F., Mishchenko R., Mantovani, L., Heller, B. OncoWorkstation - a study protocol based therapy-management tool for the adult oncology, (in Vorbereitung).

Greiner, U., Ramsch, J., Heller, B., Löffler, M., Müller, R., Rahm, E. 2004. AdaptFlow: Protocol Based Medical Treatment using Adaptive Workflows, Journal of Methods of Information in Medicine, Schattauer (in Druck).

Heller, B., Herre, H., Lippoldt, K. The Theory of Top-Level Ontological Mappings and its Application to Clinical Trial Protocols. In: Motta, E., Shadbolt, N., Stutt, A., Gibbins, N. (eds.) Engineering Knowledge in the Age of the Semantic Web: Proceedings of the 14th International Conference (EKAW 2004), Whittlebury Hall, UK, Oct 2004. Lecture Notes in Computer Science, Vol. 3257, p. 1-14. Berlin: Springer.

Greiner, U., Ramsch, J., Heller, B., Löffler, M., Rahm, E., Müller, R. 2004. Adaptive Guideline-based Treatment Workflows with AdaptFlow, In: Kaiser, K., Miksch, S., Tu, S. (eds.) Computer-based Support for Clinical Guidelines and Protocols. Proceedings of the Symposium on Computerized Guidelines and Protocols. (CGP 2004), 13.-14. April, Prag, p. 113-117. Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 101. Amsterdam: IOS Press.

Mücke, R. 2004. Untersuchung der Handhabung der Website Navigation in Content Management Systemen. In Fähnrich, K.-P., Jantke , K. P.,Wittig, W. S. (eds.) Von e-Learning bis e-Payment: Das Internet als sicherer Marktplatz. p. 135-145. Akademische Verlagsgesellschaft Aka GmbH, Berlin

Löbe, M. 2004. Erfahrungen beim Einsatz von Content Management Systemen in verteilten Forschungsnetzwerken. In Fähnrich, K.-P., Jantke , K. P., Wittig, W. S. (eds.) Von e-Learning bis e-Payment: Das Internet als sicherer Marktplatz. p. 146-155. Akademische Verlagsgesellschaft Aka GmbH, Berlin

Heller, B., Herre, H., Lippoldt, K. 2004. Domain-Specific Concepts and Ontological Reduction within a Data Dictionary Framework. In: Rahm. E. (ed.) Data Integration in the Life Sciences. (DILS 2004), 25.-26. März 2004. Leipzig. p. 47-62. Lecture Notes in Bioinformatics, Vol.2994. Heidelberg: Springer. [PDF]

Heller, B., Herre, H., Lippoldt, K., Löffler, M. 2004. Standardized Terminology for Clinical Trial Protocols Based on Ontological Top-Level Categories. In: Kaiser, K., Miksch, S., Tu, S.W. (eds.) Computer-based Support for Clinical Guidlines and Protocols. Proceedings of the Symposium on Computerized Guidelines and Protocols. (CGP 2004), 13.-14. April 2004. Prag. p. 46-60. Studies in Health Technology and Informatics, Vol.101. Amsterdam: IOS-Press. [PDF]

Heller, B., Herre, H. 2004. Ontological Categories in GOL. Axiomathes 14: 57-76. Kluwer Academic Publishers. [PDF]

Burek, P., Herre, H. 2003. Conceptual Modeling based on Upper-Level Ontologies and Meta-Ontological Foundations. In: Fähnrich, K.-P., Herre, H. (ed.) Content- und Wissensmanagement: Arbeiten aus dem Forschungsvorhaben PreBIS und Beiträge auf den Leipziger Informatik-Tagen 2003. Leipziger Beiträge zur Informatik, Vol. 1, p. 153-157. Leipzig: Leipziger Informatik Verbund (LIV).

Heller, B., Herre, H. 2003. Formal Ontology and the Research Project GOL. In: Fähnrich, K.-P., Herre, H. (eds.) Content and Knowledge Management. Leipziger Informatik-Tage (LIT 2003), 24.-26. Sept. 2003. Leipzig.

Hatje, H., Speer, R., Heller, B., Noack, F., Stein, H., Hogrefe, D., Feller, A.C., Hummel, M. 2002. Lymphknotenreferenzzentren: Aktuelle Online Studienpatienten- und Materialdatenbank. Telemedizinführer Deutschland: Ausgabe 2003, Deutsches Medizin Forum Medizin Forum AG, Ober Moerlen.

Guizzardi, G., Herre, H., Wagner, G. 2002. Towards Ontological Foundations for Conceptual UML Models. In: Meersman R, Tari Z., et al. (eds.) On the Move to Meaningful Internet Systems 2002: CoopIS, DOA, and ODBASE. Proceedings of the International Conference on Ontologies, Databases and Applications of Semantics, (ODBASE), 29. - 31. Okt. 2002. Irvine, Kalifornien. p. 1100-1117. Springer. [PDF]

Degen, W., Heller, B., Herre, H., Smith, B. 2001. GOL: A General Ontological Language. In: Welty C., Smith B., (eds.) Proceedings of the International Conference on Formal Ontology in Information Systems, (FOIS 2001), 17. - 19. Okt. 2001. Ogunquit. p. 34-46. [PDF]

Heller, B., Koch, J. 1998. Medizinische Konsiliardienste über ISDN: Externe Bilddatenkommunikation mit dem Universitätsklinikum Leipzig. In: Kunath, H., Strelocke, K., Niedostatek, A. (eds.) Telekommunikation im Gesundheitswesen. [PDF]

Mueller, R., Heller, B., Löffler, M., Rahm, E., Winter, A. et al. 1998. HematoWork: A Knowledge-based Workflow System for Cancer Therapy. Proceedings of the GMDS98, (GMDS98) 15. - 18. Sept. 1998. Bremen. p. 63-66. München: MMV Medizin Verlag. [PDF]

Speer, R., Heller, B. 1998. Einsatz moderner Kommunikationstechniken bei der Durchführung multizentrischer klinischer Studien. In: Greiser, E., Wischnewsky, M. (eds.) Methoden der Medizinischen Informatik, Biometrie und Epidemiologie in der modernen Informationsgesellschaft, (GMDS98), p. 125-129. München: MMV Medizin Verlag.

Herre, H. 1993. Semantical Completeness of Model-Based Diagnosis. In: Cardenoca J., Meseguer P., (eds.) Proceedings of the European Symposium of the Validation and Verification of Knolwedge Based Systems, (EUROVAV'93), p. 217-130.

Zusammenfassungen

Speer, R., Dolak, W., Heller, B., Meineke, F., Ramsch, J. 2003. Sicherheitskonzepte in medizinischen Forschungsverbünden. Telemed 2003, 07. - 08. Nov. 2003, Berlin.

Greiner, U., Ramsch, J., Heller, B., Löffler, M., Rahm, E. 2003. Flexible, protokollbasierte Therapie auf Basis adaptiver Workflows. 48. Jahrestagung der GMDS, 14. - 18. Sept. 2003, Münster. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 34(3): 371.

Meineke, F., Mishchenko, R., Mantovani, L. Löffler, M., Heller, B. 2003. OncoWorkstation - ein Konsultations- und Planungswerkzeug zur Unterstützung der Auswahl und Durchführung von onkologischen Therapiestudien. 48. Jahrestagung der GMDS, 14. - 18. Sept. 2003, Münster. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 34(3): 374.

Speer, R., Kuchinke, W., Meisner, C., Schwabedissen, M., Troost, R., Wittenberg, M. 2003. Systemvalidierung in klinischen Studien - Erstellung eines Validierungspakets für die KKS und andere Verbünde. 48. Jahrestagung der GMDS, 14. - 18. Sept. 2003, Münster. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 34(3): 368.

Löbe, M., Heller, B., Dietzold, S. 2002. Konzepte für ein modernes Informationsmanagement medizinischer Netzwerke. 47. Jahrestagung der GMDS, 8. - 12. Sept. 2002, Berlin. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 33(2-3): 378. [PDF]

Heller, B., Hummel, M., Speer, R. 2002. Aufbau einer standardisierten Terminologie für eine virtuelle medizinische Materialdatenbank. 47. Jahrestagung der GMDS, 8. - 12. Sept. 2002, Berlin. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 33(2-3): 379. [PDF]

Heller, B., Krüger, M., Löffler, M., Mantovani, L., Meineke, F., Mishchenko, R. 2002. OncoWorkstation - Ein adaptives Agentensystem für das Therapiemanagement klinischer Studien. 47. Jahrestagung der GMDS, 8. - 12. Sept. 2002, Berlin. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 33(2-3): 380. [PDF]

Heller, B., Lippoldt, K., Kühn, K., Löffler, M. 2002. Vorgehen beim Aufbau eines semantisch fundierten Data Dictionaries. 47. Jahrestagung der GMDS, 8. - 12. Sept. 2002, Berlin. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 33(2-3): 377. [PDF]

Heller, B., Siebert, D., Speer, R. 2002. Semantische Fundierung von Studienmanagementwerkzeugen. 47. Jahrestagung der GMDS, 8. - 12. Sept. 2002, Berlin. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 33(2-3): 381. [PDF]

Heller, B., Lippoldt, K., Löffler, M. 2001. Modell eines Data Dictionaries für Klinische Studien. 46. Jahrestagung der GMDS, 16. - 20. Sept. 2001, Köln. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 32(2-3): 170. [PDF]

Heller, B., Krüger, M., Mantovani, L., Mishchenko, R. 2001. Onco-Workstation: Ein wissensbasiertes Agentensystem zur Unterstützung der Therapie und Dokumentation in der Onkologie. 46. Jahrestagung der GMDS, 16. - 20. Sept. 2001, Köln. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 32(2-3): 201. [PDF]

Dietzold, S., Heller, B. 2001. Konzeption und Aufbau eines vertikalen Enterprise-Portals für ein medizinisches Kompetenznetzwerk. 46. Jahrestagung der GMDS, 16. - 20. Sept. 2001, Köln. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 32(2-3): 134. [PDF]

Heller, B., Hummel, M., Speer, R. 2001. Vernetzung der Referenzpathologien für Lymphknotendiagnostik und Aufbau einer virtuellen Materialdatenbank. 46. Jahrestagung der GMDS, 16. - 20. Sept. 2001, Köln. In: Informatik, Biometrie und Epidemiologie in Medizin und Biologie 32(2-3): 300. [PDF]

Speer, R., Heller, B. 1999. Object-oriented modular data dictionaries of reusable components based on registration and analysis of data in clinical trials. 44. Jahrestagung der GMDS, 13. - 17. Sept. 1999, Heidelberg. In: Abstract Volume der ISCB-GMDS-99: 429. [PDF]

Speer, R., Heller, B. 1998. Einsatz moderner Kommunikationstechniken bei der Durchführung multizentrischer klinischer Studien. 43. Jahrestagung der GMDS, 14. - 16. Sept. 1998, Bremen, In: Greiser E.; Wischnewsky M. (eds.): Methoden der Medizinischen Informatik, Biometrie und Epidemiologie in der modernen Informationsgesellschaft. München: MMV Medien & Medizin Verlag: 125-129. [PDF]

Müller, R., Heller, B., Löffler, M., Rahm, E., Winter, A., Speer, R., Berger, H., Klöss, M., Mantovani, L., Brümmer, F., Jödecke, E., Neubert, U., Fiebig, F. 1998. Methoden der Medizinischen Informatik, Biometrie und Epidemiologie in der modernen Informationsgesellschaft. 43. Jahrestagung der GMDS, 14. - 16. Sept. 1998, Bremen, In: Greiser E.; Wischnewsky M. (eds.) Methoden der Medizinischen Informatik, Biometrie und Epidemiologie in der modernen Informationsgesellschaft. München: MMV Medien & Medizin Verlag: 63-66.

Heller, B., Koch, J. 1998. Medizinische Konsiliardienste über ISDN: Externe Bilddatenkommunikation mit dem Universitätsklinikum Leipzig. 1. Sächsisches Telemedizinsymposium, 26./27. Juni 1998, Dresden. [PDF]

Forschungsanträge

Heller, B., Löffler, M., Luminari, S., Federico, M. 2003. Implementation of IT-based Measures for Quality Assurance. European Platform for the Conquest of Lymphomas (EPCOL). 6th Framework Programme of the European Commission. (eingereicht).

Heller, B., Löffler, M. 2002. Telematics and Computer-Based Quality Management in a Communication Network for Malignant Lymphoma. Kompetenznetz Maligne Lymphome. Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF).

Heller, B., Löffler, M. 2002. Einführung eines wissensbasierten Konsultationssystems für onkologische Therapieplanung. BMBF-Fördermaßnahme "Verbesserung der Leistungsfähigkeit der klinischen Forschung an den medizinischen Fakultäten der neuen Bundesländer".

Löffler, M., Rahm, E., Heller, B., Müller, R. 1998. Wissensbasiertes dynamisches Workflow-Management in klinischen Studien. Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG).

Heller, B., Löffler, M. 1998. Telematik und rechnerbasiertes Qualitätsmanagement in einem Kommunikationsnetzwerk. Antrag zur Förderung eines medizinischen Netzwerkes bei malignen Lymphomen. Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF).

Dissertationen

Dötsch, V. Eine wissensbasierte Planungskomponente für die dynamische Koordination von Studienprozessen. Graduiertenkolleg Wissensrepräsentation, Universität Leipzig, (erscheint 2005).

Junger, M. Benutzermodellierung bei der Qualitätssicherung im Studienmanagement. Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Medizinische Fakultät, Universität Leipzig, (erscheint 2005).

Diplomarbeiten

Dietzold, S. Konzept eines Frameworks für eine axiombasierte Entwicklung von Semantic Web Ontologien auf Basis der Web Ontology Language (OWL). Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig, (erscheint 2005).

Höhndorf, R. 2005. Situoid theory: An ontological approach to situation theory. (Situoid-Theorie: Ein ontologischer Ansatz für Situationstheorie.) [Diplomarbeit] Institut für Informatik, Universität Leipzig. [PDF]

Kühn, K. 2004. A Model for a Data Dictionary Supporting Multiple Definitions, Views and Contexts. (Modell eines Data Dictionary mit Unterstützung für alternative Definitionen, Sichten und Kontexte.) Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig, (verfasst in Englisch). [PDF]

Loebe, F. 2003. An Analysis of Roles: Towards Ontology-Based Modelling. (Eine Untersuchung von Rollen im Hinblick auf ontologie-basierte Modellierung). Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig, (verfasst in Englisch). [PDF]

Löbe, M. 2001. Hochverfügbare Middlewareplattform für ein mobiles Patientenbetreuungssystem. Institut für Informatik, Universität Leipzig. [PDF]

Lippoldt, K. 2000. Festlegung von zielgerichteten differentiellen Dokumentationsprozessen am Beispiel der Integration der Referenzzentren für Pathologie innerhalb des Kompetenznetzwerkes Maligne Lymphome. Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig. [PDF]

Krüger, M. 1999. Konzeption und Realisierung eines wissensbasierten Protokollauswahlmodul für die Hämatoonkologie. Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig.[PDF]

Jödecke, E. 1997. Konzept und Implementierung eines datenbankgestützten Dokumentenstruktur-Editors und -Generators. Institut für Informatik. Fakultät für Mathematik und Informatik, Universität Leipzig.

Berger, H. 1997. Konzeption und Implementierung eines Konsultationssystems zur Therapieplanung in der Erwachsenenonkologie. Universität Heidelberg und Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig.